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Die Schwerpunkte der halleschen Universität liegen hauptsächlich in den Bereichen Physik, Biologie, Medizin, Chemie, Pädagogik und Kunst. Dabei sind die Schnittgebiete der einzelnen Disziplinen sehr erfolgsversprechend. So ist die Forschungsarbeit auf den Gebieten des Einsatze physikalischer und chemischer Methoden zur Unterstützung der Medizin und Biologie weltklasse.
Folgerichtig haben sich einige wichtige Forschungsinstitute in Halle angesiedelt. Hier sieht man das Max-Planck Institut für Mikrostrukturphysik.